V6が全国の名門校をリポートする。今回、井ノ原と三宅が訪れたのは、増田明美や室伏広治など、世界で活躍するアスリートを輩出した、千葉県・成田高校。さっそく成田高校に着いた2人は、「まず、ヤツに会いに行かなきゃね」と、昨年放送したチアダンス部の男子部員・佐藤くんと再会を果たす。佐藤くんが「学校へ行こう！MAX」以外にもテレビ番組に取り上げられ、人気を集めていると知った井ノ原は、「うちにも協力してもらわないと！」と佐藤くんに成田高校めぐりのナビゲートを依頼する。関東大会3回出場、ことしも県大会優勝を手にした弓道部、毎年全国大会に出場している名門の音楽部、史上最多・7度のインターハイ総合優勝を誇る陸上部など、全国レベルで活躍する部活が紹介される。
番組宛に、ある1通の手紙が届いた。それは、史上最年少で暗算10段を取得した、岐阜県の小2・赤堀愛果ちゃん。彼女は、2004年10月放送の「学校へ行こう！」で驚異的な暗算力を見せた、土屋宏明くん（当時高校3年）に憧れていて、会いたいのだという。坂本と森田は、詳しい話を聞くために、愛果ちゃんの自宅へ。そして、フラッシュ暗算にチャレンジしてもらい、愛果ちゃんの実力を見せてもらう。10歳とは思えない愛果ちゃんの暗算力を確認したV6は、いよいよ土屋くんとの対面プロジェクトをスタートさせる。
鉄道好き学生を応援する企画の第2弾。ゲストは、KAT-TUNの田中聖、栗山千明、塚本高史、秋山竜次（ロバート）。現在放送中の鉄道をテーマにしたドラマ『特急田中3号』は、実際に使われている駅の構内や鉄道内で撮影しているものの、朝や深夜の時間帯が多く、出演者たちは純粋に鉄道を楽しめていないという。そこで、長野と三宅、さらに『特急田中3号』で鉄道監修を務めるホリプロ・マネージャーの南田氏は、出演者と“T4”を連れ、鉄道の旅へ案内する。
ハリウッドの大物スターから、ビッグオファーを受けた「学校へ行こう！」。そこで番組は、天才エレクトーン少女・怜ちゃんをニッポン学生の代表に指名し、ある大プロジェクトをスタートさせる。
全国の学生たちが、60秒の間にいろいろなテーマについて自由にレポートする。今回は、静岡県の中1・五十嵐あゆみさんが小学校時代の先生の、あるユニットを紹介する「ゆずゆLIVE」、静岡県の高3・勝亦司くんの「寝起きドッキリ男子寮」続編、前回「その後の合唱部」をリポートした宮崎県の高3・橋口勇輝くんの「プライベート・リポート」、和歌山県の小6・岡野幸輔くんの「タケノコ掘り」を放送。そんな中、VTRを観ているスタジオで、井ノ原にある異変が起きる。
V6が全国の名門校をリポートする。井ノ原と森田が訪れたのは、兵庫県の武庫川女子大学付属中学・高等学校。理系のお嬢様学校として知られる武庫川女子のスゴイところを、あいうえお作文風に紹介する。海外でも活躍するコーラス部、歴史上の有名人の子孫が所属するマーチングバンド部などを見学し、2人はハリーポッター系の美女軍団がいるという、スーパーサイエンスコースへ。世界で活躍する科学者を育てるこのクラスは、高校とは思えない研究が行われていた。液体窒素を使った実験では、井ノ原に「液体窒素に指を入れてみてください」と先生。井ノ原は「そんなの中止ですよ！」と言いながらも、マイナス196℃の液体窒素の中に指を入れるはめに。また、NHK杯全国放送コンテストに連続出場を果たしている放送部では、井ノ原が昼休みの電波ジャックを提案。2人はゲスト出演することに。
空前の鉄道ブームにありながら、女子にはマイナスイメージを持たれている、鉄道マニアこと“鉄ちゃん”。しかし、マネージャーでありながらメディアで活躍している鉄道マニア、ホリプロの南田氏の情報によると、鉄道界には“F4”ならぬ“T4”がいるという。そこで坂本と三宅は、女子代表として夏帆を引き連れ、南田氏に詳しい話を聞くことに。そして3人は、南田氏の案内のもと、T4が集まっているという早稲田大学・鉄道研究会へ向かう。超一流大学に在学している彼らが、鉄道へのアツイ思いや自慢の逸品を披露し、鉄道の魅力を話すのだが、イマイチ納得のいかない3人。そこで、南田氏が「世界一受けたい鉄道講座」を開講する。
5/1に放送された「ニッポンの天才少年少女」の続編。スタッフが天才エレクトーン少女・木下怜ちゃんの近況を聞くと、先生からまたもや1本のVTRが送られてきた。あまりのかわいさに感激した坂本と三宅は、もう一度怜ちゃんに会いに行くことに。三宅が「坂本くん、骨抜きになってたもんね」と言うと、笑顔で「癒されます！」と坂本。「でも、その前にもっとステキな人に会わなければいけません！」と前回強烈な印象を残した山崎先生に動物園で再会を果たす。「今回も、素晴らしいパフォーマンスを用意しています」という先生に連れられエレクトーン教室へと向かったV6は、前回よりもさらにパワーアップしたパフォーマンスを目の当たりにする。
V6が全国の名門校を紹介する。坂本と三宅が訪れたのは、京都府・洛南高校。17年連続京都大学合格者数No.1を誇り、運動部、文化部ともに優秀な成績を収めている洛南高校は、文武両道のエリート校。そこで、“洛南高校のスゴイところ ベスト10”をランキング形式で紹介する。五重塔など絶景が見渡せる教室に感動した三宅は、坂本に「ココで一句！」と強引な注文を。何とか句を詠んだ坂本だったが、生徒たちに苦笑いされてしまう。その後、礼儀正しい吹奏楽部や高校生No.1シューターのいるバスケットボールなど、全国で活躍するさまざまな部活動がランクインする。
全国の学生たちが、60秒間でいろいろなテーマについてリポートする。今回は、京都府の小4・波部莉子さんの「自慢の設備」、静岡県の高3・勝亦司くんの「寝起きドッキリ男子寮」、大阪府の小6・蔵元謙介・竜介くん兄弟の「不思議なバスケ部」、愛知県の中1・及川絢香さんの「素敵なカップル」などを紹介。そして、宮崎県の高3・橋口勇輝くんの「その後の合唱部」では、2年前「学校へ行こう！」で追い続けた、あの男子合唱部の今をリポートする。
三重県・猪名部神社で800年以上前から行われている伝統行事・上げ馬神事を紹介。斜度40度、高さ2メートルの絶壁を馬に乗って飛び越えるこの行事は、毎年、青年団からクジによって選ばれた6人の乗り子たちが挑戦し、何人成功するかによってその年の作物の出来を占っている。乗り子に選ばれた6人は、1カ月間の猛特訓を受け、さらに本番前の1週間は親元を離れて生活するという。坂本と三宅は、彼らが生活する区民会館を訪れ、今年乗り子に選ばれた高3・伊藤圭吾くんに詳しい話を聞く。圭吾くんは、乗り子に選ばれながらケガをしてしまい、参加することができなかったお父さんの夢を果たしたいと熱い気持ちを語る。そして、いよいよ本番当日を迎える。
山口県にすごい才能を持った、4歳のエレクトーン少女・木下怜ちゃんがいると聞いた番組スタッフ。先生にコンタクトを取ると、ある1本のVTRが届いた。そのVTRを見て「かわいい!!」「あんな動き、見たことないよね」と興味を持った坂本と長野が、さっそく怜ちゃんを教えている山崎先生に会いに行く。山崎先生は、パフォーマンスを取り入れたエレクトーンを提案し、教え子たちに数々の賞を獲得させた経歴の持ち主。V6は、先生と一緒に生徒たちがいる教室へと移動し、演奏を見せてもらう。ユニークなパフォーマンスを見た坂本は、「（生徒たちを）持って帰りたいですもん!!」と大感激。音楽を体で表現することも大切なポイントだという先生の言葉を受けて、坂本と長野も体験レッスンを受けることに。
全国の学生たちが、60秒間でいろいろなテーマについてリポートする。今回は、広島県の小4・大瀬戸泰樹くんの「クラスで流行っていること」、青森県の高2・小崎聖菜さんの「おもしろい名前」、京都府の小6・福田萌さんの「最高の場所に立つ学校」、そして、アナウンサー出身のみのが絶賛した愛媛県の中3・高橋茜さんの「早口言葉」の60秒リポートを紹介。そして、前回話題になったシリーズ第2弾として、大阪府の小5・松下由季さんが友達の告白をリポート。転校を控えた女の子が好きな同級生に思いを伝えるのだが…。
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